除馬公本島、北海、南海及東海等傳統遊程之外，澎湖南邊海域還分佈著其他諸島，因交通不便，較少人前往旅遊，但這些島都各有特色，且因未觀光化，也還維持著最原始自然的樣貌。流浪鯨魚希望慢慢開發這些島嶼的觀光動線，以限額限量的方式，讓旅人有機會一親芳澤。當然，交通就是一個很大的問題。除花嶼有交通輪(益安三號，從南海遊客中心登船)，其他各島都在南海海域，從望安包漁船前往是較好，有時也是唯一的方法…
推薦景點：
 |
 |
 |
 |
 |
花嶼 | 位於澎湖島嶼最西端。是一砏岩所構成的島嶼，而非構成澎湖列島的玄武岩。現住民有一百多人，以捕漁為業，是很純樸的傳統漁村，人與人的關係單純而友善，整座島就好像是一大家庭。它早期是很豐富的小管漁場，這幾年漁業下滑，因漁場被毒、電、炸魚所嚴重破壞。島上有一燈塔，是澎湖極西海域最重要的明燈。因破壞少，島嶼附近的珊瑚礁地形及魚群都很豐富。 |
|
貓嶼 | 距離花嶼約二十分鐘的漁船航程，可由花嶼雇漁船前往。是全台灣第一個鳥類保護區，島上有多種燕鷗，以玄燕鷗為主角，可惜不能登島觀賞，只能巡航一圈觀察。島的形狀像大小兩隻貓相對峙，大貓的貓背是澎湖最高點，為七十九公尺高。其旁的草嶼，為早期國軍飛彈試射所在地，如今，是花嶼人最重要的採蚵聖地。 |
|
東吉嶼 | 位於澎湖列島東南邊，昔日因黑水構在外海，水流湍急而形成良好漁場。但和花嶼一樣，因為漁場被破壞，居民在五、六○年代台灣經濟起飛，工作機會增加而逐漸搬出。全盛時期島上有三千居民，如今不到百人。東吉舊港外海，有很驚人的珊瑚礁覆蓋率，被譽為全澎湖最美的潛水區。島上風景秀麗，有大片草原，有絕美懸崖，也有很美的古厝。西邊有已是無人島的西吉嶼遙遙相對。 |
|
東嶼坪嶼 | 位於七美與望安之間，也是很美的有人島，只是，還有人居住的現況也不知可維持多久!一如東吉嶼，它的玄武岩及懸崖地形也很發達，也還維持著幾間堪住的美麗古厝，見證著它的昔日風華。它的外海同樣有很美的珊瑚群，是浮潛天堂，而且可以一面看著玄武岩柱，是非常特殊的体驗。它的旁邊就是西嶼坪，與東嶼坪合稱嶼坪。 |
|
頭巾嶼 | 頭巾嶼同樣位於望安與七美之間，是海蝕平台與海蝕柱共同構成的島嶼。要有能「靠礁」的漁船才能上島。島上有很美的大潮池，各種生物共同生活其中，生機盎然。燕鷗也喜於在島上築巢，到夏天時熱鬧非凡，是鳥的天堂，但不是人類的，因其特殊地形，平常除釣客外，少人造訪。 |
沿線美食：
- 三級離島多只有雜貨店，住花嶼村長家可以搭伙，吃在地餐是在花嶼令人期待的。其他小島美食有待開發。無人島的吃就要靠自己了。
鯨魚叮嚀：
- 到這些無人島的最大問題就是交通，除了花嶼交通輪的班次固定，其他各島請先找熟悉船家，議價後再確定出發細節。民宿可幫您居中聯絡較熟船家。
- 要上頭巾嶼等無人島，請著膠鞋及手套，以避免發生滑倒等意外。另外，不善泳的旅人請著救生衣以防落海。
- 因島上資源有限，要上這些島嶼，請自備簡單乾糧。把這樣的特殊旅程當做登山，有需要時可自備炊具及食材，可在島上炊煮。
- 澎湖的島嶼愈偏遠愈迷人，特別是原本居民眾多，但現在幾乎快成無人島的各島(花嶼、東吉、東嶼坪等)，除了自然景緻外，也有人文之美，更有看頭。如果可克服交通問題，建議玩家級的澎湖老手儘早規劃偏遠離島行程，以深入真正的原味澎湖。然而，盡可能了解島上狀況，衡量自身條件，做好萬全準備，保持安全警覺仍是從事此特殊旅程之基本前提。